华中农业大学学报

北大核心,CA,JST,CSCD,WJCI

国内刊号:42-1181/S

国际刊号:1000-2421

华中农业大学学报杂志2025年第4期:基于GWAS的哺乳仔猪抗腹泻候选基因筛选及通路研究

发布日期:

作者:黄睿,陈栋,赵真坚,申琦,崔晟頔,王俊戈,陈子旸,吴平先,唐国庆

单位:1.猪禽种业全国重点实验室/四川农业大学动物科技学院/农业农村部畜禽生物组学重点实验室/ 畜禽遗传资源发掘与创新利用四川省重点实验室,成都 611130;2.国家生猪技术创新中心,重庆 402460

关键词:哺乳仔猪;GWAS;腹泻;抗腹泻;基因;通路

基金:国家生猪技术创新中心先导科技项目(NCTIP-XD/B01);四川省科技厅项目(2020YFN0024;2021ZDZX0008;2021YFYZ0030)

为研究哺乳仔猪抗腹泻的遗传因素和通路,通过对640头腹泻仔猪进行采样和统计分析,选取其中600个样本,包括大白猪453头、长白猪105头和杜洛克猪42头进行低深度重测序(1×),对测序结果质控后开展全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS),在大白猪和长白猪中分别筛选出42个和107个显著SNPs,这些位点上下游20 kb区域分别涉及32个和82个基因,对这些基因进行GO和KEGG富集分析,最终分别确定了6个(PLA2G4A、C1RL、PTPN6、C1R、PPP1R12A和GRID2)和8个(DAPK1、TMC8、ITM2C、CHMP4B、CAST、PDE4D、HSPA4和GRID2)可能与哺乳仔猪腹泻性状相关的重要候选基因,其中GRID2在大白猪和长白猪中同时被筛选到。结果表明,仔猪腹泻性状候选基因与细胞凋亡、免疫、细胞屏障和物质的跨膜运输相关功能有关。

来源:2025年第4期

《华中农业大学学报》期刊编辑部

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