华中农业大学学报

北大核心,CA,JST,CSCD,WJCI

国内刊号:42-1181/S

国际刊号:1000-2421

华中农业大学学报杂志2024年第5期:青贮玉米品质相关性状的全基因组关联分析

发布日期:

作者:刘鹏飞,王栋,陈泽辉,郭向阳,吴迅,王安贵,涂亮,祝云芳

单位:1.贵州省农业科学院旱粮研究所,贵阳 550006;2.贵州大学农学院,贵阳 550025;3.农业农村部喀斯特山区作物基因资源与种质创新重点实验室,贵阳 550006

关键词:青贮玉米;品质性状;全基因组关联分析;单核苷酸多态性位点;优异等位变异;候选基因

基金:国家自然科学基金项目(32171981;32060460;32160451);贵州省自然科学基金项目(黔科合基础[2022]一般236);贵州科技计划项目(黔科合基础-ZK[2023]一般173);贵州省科技支撑计划(黔科合支撑[2022]重点029);贵州省重大科技成果转化项目(黔科合成果[2024]重大009)

为了初步揭示玉米粗蛋白含量、淀粉含量、中性洗涤纤维(neutral detergent fiber, NDF)含量、酸性洗涤纤维(acid detergent fiber,ADF)含量、可溶性糖含量和体外干物质消化率等性状的遗传规律,按照随机区组设计将183份自交系为材料种植于贵阳,测定玉米粗蛋白含量、淀粉含量、NDF含量、ADF含量、可溶性糖含量和体外干物质消化率,利用Maize SNP 50芯片对供试材料进行基因分型,采用混合线性模型进行全基因组关联分析,结果显示,分别鉴定出31、61、11、36、20和42个与粗蛋白、淀粉、NDF、ADF、可溶性糖及体外干物质消化率显著相关的单核苷酸多态性位点(SNP)(P<0.001),对表型变异的解释率分别为5.80%~11.40%、5.78%~11.38%、5.78%~7.85%、5.81%~10.37%、5.78%~7.35%和5.79%~11.33%。同时,发现SYN6712、PHM1190.3、SYN7541和PZE-104072386属于一因多效位点;其中,6号染色体上的SYN6712、PHM1190.3和SYN7541同时与淀粉、体外干物质消化率显著关联,4号染色体上的PZE-104072386同时与ADF、可溶性糖显著关联,经过等位变异鉴定发现T/T基因型是SYN6712和PHM1190.3的优异等位变异,并挖掘到了Zm00001d037272、Zm00001d037386、Zm00001d037532和Zm00001d051166等候选基因。

来源:2024年第5期

《华中农业大学学报》期刊编辑部

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