华中农业大学学报

北大核心,CA,JST,CSCD,WJCI

国内刊号:42-1181/S

国际刊号:1000-2421

华中农业大学学报杂志2021年第6期:半夏SSR分子标记开发与遗传多样性

发布日期:

作者:张景,李晓东,宗庆波,何贝贝,拉基,景纳良,王柯月,钟淑梅,舒少华

关键词:半夏; 转录组; 简单重复序列分子标记; 遗传多样性; 居群

基金:国家重点研发计划项目“中药材生态种植技术研究及应用”(2017YFC1700700);湖北省技术创新重大项目“湖北省重点道地药材品种选育及配套关键技术研究”(2017ACA175);知音英才计划项目“半夏优良品种培育及产业化”;湖北省农业科技创新行动

对半夏转录组数据进行分析,设计开发SSR引物,利用筛选出的SSR引物分析不同居群间半夏的遗传多样性,为半夏分子标记辅助育种提供支撑。结果显示:筛选出的19对多态性较高的引物在17个半夏居群中共检测到49个多态性位点,具有较高的多态性;利用UPGMA作图共将17个半夏居群分为3个类群;通过分子方差分析(AMOVA)发现半夏居群内的变异达到88%,说明群体与群体间的差异相对较小,遗传变异主要来源于个体间;居群间平均分化系数Fst为0.124,居群间基因流 Nm 值为1.765,表明居群间能正常地进行基因交流,且居群间遗传分化受基因流的影响较大。本研究利用SSR技术开发的19对SSR引物在不同半夏居群间具有一定的通用性、多态性,能将17份半夏材料明确区分。

来源:2021年第6期

《华中农业大学学报》期刊编辑部

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