华中农业大学学报

作者：陈阳雪，赵晓佳，谈家金

关键词：转录组分析; 松材线虫; 马尾松内生细菌GD2; 差异表达基因; 线虫细菌微生态

基金：国家重点研发计划项目（2018YFC1200400）

为了进一步阐明细菌在松材线虫病中的作用，采用松材线虫（CK）和松材线虫与马尾松内生细菌GD2 的混合物（T）分别接种马尾松，对松材线虫进行转录组测序、 Gene Ontology（GO）及 KEGG 富集分析，并利用 Realtime Quantitative PCR(RTqPCR)验证目标基因表达情况。结果显示，与对照组（空白虫）CK相比，共筛选到143个差异表达基因(differentially expressed genes，DEGs)，其中有 63 个上调基因，80 个下调基因。Gene Ontology 分析显示，差异表达基因在免疫系统过程、细胞膜、代谢过程、转运活性等功能类富集。KEGG 通路在ECMreceptor 互作、肾素血管紧张素、糖酵解、胰岛素信号等通路富集。这些GO 功能与KEGG 通路涉及机体的免疫调节。选取 8 个基因进行RTqPCR 验证，表达水平与测序结果一致，证明了测序结果的准确性。表明菌株GD2可以通过提高松材线虫的免疫调节能力来影响松材线虫病的发生。

来源：2021年第5期

《华中农业大学学报》期刊编辑部

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