国内刊号:42-1181/S
国际刊号:1000-2421
发布日期:
作者:薛亚莉,魏晓双,周海连,李朝阳,胡利华,王令强,张翠翠
关键词:水稻; LEA_2; 非生物逆境胁迫; 生物信息学; 干旱胁迫; 冷胁迫; 淹水胁迫; 盐胁迫; 渗透胁迫
基金:广西自然科学基金项目(2018GXNSFAA281116); 国家重点研发计划项目(2018YFD0301303); 国家自然科学基金项目(31771775; 31171524)
为探索水稻LEA_2家族成员的特点,通过生物信息学分析从水稻基因组中鉴定出60个LEA_2家族成员,它们不均匀分布于12条染色体。蛋白序列分析结果显示,LEA_2家族蛋白的分子质量为16.24~49.14 ku,等电点4.7~11.7,有42个蛋白倾向于疏水;系统进化树分析显示,LEA_2家族可以分成5个组,同一组的蛋白成员包含的保守基序类型基本相同;基因结构分析表明LEA_2基因包含少量的内含子或者不含内含子;启动子分析表明水稻LEA_2基因启动子包含大量与逆境胁迫响应、激素信号传导及生长发育有关的作用元件。根据表达谱分层聚类分析及荧光定量PCR实验发现水稻LEA_2家族基因间共表达现象明显,同时发现OsLEA2-2和OsLEA2-26基因均受干旱胁迫上调表达60倍以上。
来源:2021年第2期
《华中农业大学学报》期刊编辑部