国内刊号:42-1181/S
国际刊号:1000-2421
发布日期:
作者:覃悦,祝友朋,韩长志
关键词:黄单胞菌; 分泌蛋白; 理化性质; 生物信息学分析; 植物病原菌; 亚细胞定位; 转运肽
基金:国家自然科学基金项目(31960314);云南省应用基础研究计划项目(2018FG001-028);云南省研发经费投入补助项目(2016YB462&2017YB236)
基于全基因组序列已经公布的黄单胞菌Xanthomonas campestris B100、Xanthomonas campestris pv. campestris 8004、Xanthomonas campestris CN14中分泌蛋白序列为基础数据,采用Protscale、SMART、TargetP 2.0 Server等生物信息学分析软件对上述分泌蛋白展开理化性质、保守结构域以及转运肽等分析,结果显示:黄单胞菌中分泌蛋白理论等电点与氨基酸长度之间无相关关系, 44.73%的蛋白为不稳定蛋白, 83.21%的蛋白亲水性小于0,属于亲水性蛋白。同时,在每种黄单胞菌的分泌蛋白中,具有明显保守结构域的蛋白数量平均为12个,并且所有分泌蛋白均具有信号肽,转运肽预测可能性分布也较为平均。
来源:2020年第6期
《华中农业大学学报》期刊编辑部