华中农业大学学报

北大核心,CA,JST,CSCD,WJCI

国内刊号:42-1181/S

国际刊号:1000-2421

华中农业大学学报杂志2019年第4期:萝卜蚜有翅型和无翅型转录组差异分析

发布日期:

作者:张秋圆

关键词:萝卜蚜; 转录组; 生物信息学分析; 差异表达基因

基金:国家自然科学基金项目(31572329);公益性行业(农业)科研专项(201303028)

采用Illumina测序平台获得了萝卜蚜转录组数据,有翅蚜和无翅蚜混合样本共得到107 992 806条Cleaning Reads,组装得到69 588条Unigene序列,平均长度为716 bp。有翅蚜测序结果共得到44 620 184条Cleaning Reads;无翅萝卜蚜测序结果共得到47 113 716条Cleaning Reads。2组样品差异表达基因的分析表明共有显著性差异表达基因104个,其中表达上调基因有74个,表达下调基因有30个。对差异表达基因进行GO注释及KEGG富集分析显示,Hippo信号通路、甲状腺激素信号通路和催产素信号通路与翅型分化及与之紧密联系的生殖率差异相关性较强。

来源:2019年第4期

《华中农业大学学报》期刊编辑部

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