国内刊号:42-1181/S
国际刊号:1000-2421
发布日期:
作者:吴文新
关键词:团头鲂; 固醇调节元件结合蛋白1; 克隆; 表达
基金:国家自然科学基金项目(31401976)
为阐明团头鲂SREBP1的功能,采用RT-PCR技术克隆获得SREBP1基因的cDNA序列,利用荧光定量 PCR(qRT-PCR)检测SREBP1基因在不同发育时期及不同组织中的表达情况。生物信息学分析发现,SREBP1基因cDNA的编码序列(coding sequence,CDS)为3 426 bp(GenBank登录号:MH633449),开放阅读框(ORF)编码1 141个氨基酸,与大西洋鲑、斑马鱼、草鱼、鲤、金线鲃SREBP1的氨基酸序列相似性较高(74%~99%)。保守结构域分析显示,团头鲂SREBP1蛋白具有SREBPs家族典型的“碱性螺旋环螺旋亮氨酸拉链”(bHLHZip)结构域。表达分析结果显示,SREBP1基因在团头鲂胚胎发育过程中的表达呈现先下降后增高的趋势,在眼囊期最低,至出膜期达到最高。在团头鲂幼鱼中,SREBP1在脑组织中的表达量最高,其次是眼、肝脏、心脏、肌肉、脂肪组织、肾脏,鳃中表达量最低。在成鱼中,SREBP1在脑组织表达量最高,其次是性腺组织、肌肉、肝脏、眼,肾脏、脾脏和心脏中的表达量较低。以上结果表明,SREBP1基因在团头鲂幼鱼和成鱼的不同组织中的表达模式存在差异。
来源:2019年第2期
《华中农业大学学报》期刊编辑部